Net als veel andere herdershonden kampt de Zwitserse witte herdershond met heupdysplasie en degeneratieve myelopathie (aantasting van het ruggenmerg). Bij dit ras kan een gendefect voor komen, waardoor de honden niet tegen bepaalde medicatie en narcosemiddelen kunnen. Deze multidrug resistance gen 1 deficiëntie is ernstig en niet te behandelen. De hond heeft er zijn hele leven last van. Er bestaat een DNA-test om dragers en lijders van MDR1-gen deficiëntie en DM op te sporen, waarmee kan worden voorkomen dat er meer honden met deze aandoeningen worden voortgebracht. Verder zijn er weinig aandoeningen beschreven voor dit ras.